Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Ccdc88cQ6VGS5 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Ccdc88cQ6VGS5 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Ccdc88cQ6VGS5 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Ccdc88cQ6VGS5 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Ccdc88cQ6VGS5 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
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Ccdc88cQ6VGS5 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Ccdc88cQ6VGS5 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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