Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms