Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Gad1-201ENSMUST00000094934 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Slc36a2-201ENSMUST00000039305 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Zmat2-201ENSMUST00000001419 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Adam1b-201ENSMUST00000079368 3338 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Sh2d3c-201ENSMUST00000074248 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Upp2-201ENSMUST00000059102 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Pklr-202ENSMUST00000107482 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Tyw3-204ENSMUST00000170461 4270 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Gm7103-201ENSMUST00000195642 1852 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Mc4r-201ENSMUST00000057942 2758 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Reep1-203ENSMUST00000212792 3339 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Ggct-202ENSMUST00000131475 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Nop58Q6DFW4 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Bloc1s6-201ENSMUST00000005954 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 H2-Eb2-201ENSMUST00000050325 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Sncaip-203ENSMUST00000163742 3272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Npnt-205ENSMUST00000117456 3383 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Nop58Q6DFW4 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Gm38199-201ENSMUST00000192013 3277 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Sfi1-218ENSMUST00000153425 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Nop58Q6DFW4 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Nop58Q6DFW4 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Nop58Q6DFW4 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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Nop58Q6DFW4 Bbs7-201ENSMUST00000040148 2599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Colq-205ENSMUST00000150054 2867 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Sdhc-202ENSMUST00000111336 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Anks1b-210ENSMUST00000182113 3553 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Fam122b-201ENSMUST00000071023 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Pds5a-201ENSMUST00000031104 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 9530026P05Rik-201ENSMUST00000181121 2142 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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