Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Slc2a1-201ENSMUST00000030398 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Fam122b-201ENSMUST00000071023 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Nlgn3-206ENSMUST00000151528 8541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Uroc1-201ENSMUST00000046128 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Mab21l3-201ENSMUST00000061831 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Helz-201ENSMUST00000075012 6218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Ash2l-203ENSMUST00000110609 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 AC117648.1-201ENSMUST00000219777 2510 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 C230057M02Rik-201ENSMUST00000212334 3306 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Clcn1-201ENSMUST00000031894 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm30132-201ENSMUST00000212816 8757 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 B4galt4-204ENSMUST00000114711 1481 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Sfi1-210ENSMUST00000140846 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Carmil1-202ENSMUST00000110398 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Pms2-209ENSMUST00000148011 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Ophn1-202ENSMUST00000113826 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm42633-201ENSMUST00000198853 2764 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Zfp672-202ENSMUST00000064786 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Sept6-201ENSMUST00000053456 4673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Tmem255a-202ENSMUST00000089054 3311 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 9130019O22Rik-201ENSMUST00000049052 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Bloc1s6-201ENSMUST00000005954 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm26668-201ENSMUST00000181125 3635 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Wdr62-201ENSMUST00000108190 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Ptk2b-202ENSMUST00000089250 3903 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Stx16-201ENSMUST00000044638 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Fbxl20-201ENSMUST00000103143 8601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Rbm10-203ENSMUST00000084383 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Zc3hav1-203ENSMUST00000114900 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Fgd4-204ENSMUST00000161188 2214 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Nt5c1b-217ENSMUST00000219826 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Tyw3-204ENSMUST00000170461 4270 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 BC005624-201ENSMUST00000028205 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Cbfa2t2-201ENSMUST00000045270 6069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gys1-201ENSMUST00000003964 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Slc36a2-201ENSMUST00000039305 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Eea1-201ENSMUST00000053484 7749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 4930478P22Rik-203ENSMUST00000202026 2060 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Sbno2-201ENSMUST00000042771 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 AC122293.1-201ENSMUST00000218333 2231 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms