Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Vwce-201ENSMUST00000055115 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms