Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V2

Tradd, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraddQ3U0V2 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Arhgef9-204ENSMUST00000113882 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Timm9-208ENSMUST00000221797 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Alppl2-201ENSMUST00000027455 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Man1b1-201ENSMUST00000042390 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Fxr1-208ENSMUST00000200392 3014 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Gpm6b-204ENSMUST00000112226 3174 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Ilf3-208ENSMUST00000214758 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Rps6kc1-201ENSMUST00000061611 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Gsdmc3-203ENSMUST00000190682 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Zscan21-202ENSMUST00000080732 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 C230057M02Rik-201ENSMUST00000212334 3306 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Igf2bp2-202ENSMUST00000115379 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Slco5a1-206ENSMUST00000147606 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Cul2-206ENSMUST00000162301 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Mmp9-201ENSMUST00000017881 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Lnpk-201ENSMUST00000064503 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Tnip1-205ENSMUST00000108886 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Zfp114-201ENSMUST00000086010 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Zfp944-201ENSMUST00000115535 2784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Gabra5-203ENSMUST00000206734 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Galnt16-201ENSMUST00000021558 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Idua-201ENSMUST00000071650 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Gm4454-201ENSMUST00000190585 2578 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Tnk2-206ENSMUST00000115125 4313 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Ntrk3-206ENSMUST00000195262 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Odf2-205ENSMUST00000113757 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Xrcc2-201ENSMUST00000030773 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 AC117656.2-201ENSMUST00000224931 2215 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Bbs9-209ENSMUST00000147405 3045 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 1700055D18Rik-202ENSMUST00000186030 3720 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Kcnv1-201ENSMUST00000022967 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Pus7l-201ENSMUST00000049151 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Gm26614-201ENSMUST00000180386 3909 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Gm42879-201ENSMUST00000198656 2214 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Gm13938-201ENSMUST00000156809 493 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TraddQ3U0V2 Dubr-202ENSMUST00000186535 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms