Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 1700022A22Rik-202ENSMUST00000187130 1458 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Pfn4-202ENSMUST00000178879 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm12415-201ENSMUST00000141637 512 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm17250-201ENSMUST00000180494 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm7160-201ENSMUST00000185535 471 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm19798-201ENSMUST00000201502 457 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Ift172-206ENSMUST00000201809 405 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 AC139579.1-201ENSMUST00000214560 606 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm18623-201ENSMUST00000219860 953 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm38309-201ENSMUST00000192063 1518 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Cd1d2-203ENSMUST00000194208 1527 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Oosp2-201ENSMUST00000121793 677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 A730090N16Rik-201ENSMUST00000160137 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm24180-201ENSMUST00000179961 110 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm31466-201ENSMUST00000195457 916 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 D830044I16Rik-203ENSMUST00000205437 1016 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm7001-201ENSMUST00000219384 1465 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm19001-201ENSMUST00000222736 1651 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm16418-201ENSMUST00000118577 171 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm22481-201ENSMUST00000122562 192 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Pard3bos3-201ENSMUST00000147177 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Arpp19-207ENSMUST00000169188 216 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm18857-201ENSMUST00000210421 901 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Hormad2-202ENSMUST00000109948 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm12904-201ENSMUST00000117451 1399 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Stat1-203ENSMUST00000186057 3998 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Abcc12-205ENSMUST00000152438 3083 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gstm6-204ENSMUST00000106684 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 4933424L21Rik-201ENSMUST00000142486 1186 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm6467-201ENSMUST00000171547 609 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm18538-201ENSMUST00000204265 484 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Eif3k-202ENSMUST00000207683 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm2716-201ENSMUST00000212350 643 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 AC116797.2-203ENSMUST00000225290 565 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 AC116390.1-201ENSMUST00000227975 670 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Tpd52-202ENSMUST00000091354 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Lrrcc1-202ENSMUST00000108370 3359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Rnf13-201ENSMUST00000041826 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Rpsa-ps11-201ENSMUST00000118446 889 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 0610033M10Rik-202ENSMUST00000205236 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm35696-202ENSMUST00000220364 778 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 AC160931.1-201ENSMUST00000223298 413 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Olfr418-201ENSMUST00000059754 991 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Ppp6c-205ENSMUST00000204701 1495 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Olfr543-202ENSMUST00000219647 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Dcstamp-205ENSMUST00000228556 1684 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Diablo-207ENSMUST00000145152 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms