Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

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Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Ttc21bQ0HA38 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Gm7861-201ENSMUST00000110749 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Gm7849-201ENSMUST00000110752 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Gm15793-201ENSMUST00000121857 495 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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Ttc21bQ0HA38 Gm26750-201ENSMUST00000181718 711 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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Ttc21bQ0HA38 Gm42133-201ENSMUST00000196076 637 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Gm43821-201ENSMUST00000199198 729 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Ttc21bQ0HA38 AC165260.2-201ENSMUST00000225371 395 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Ttc21bQ0HA38 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Gm38048-201ENSMUST00000193778 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Ttc21bQ0HA38 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Ttc21bQ0HA38 Tex35-206ENSMUST00000187546 856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Ttc21bQ0HA38 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc21bQ0HA38 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc21bQ0HA38 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc21bQ0HA38 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc21bQ0HA38 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc21bQ0HA38 Fkbp6-201ENSMUST00000044972 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc21bQ0HA38 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc21bQ0HA38 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc21bQ0HA38 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc21bQ0HA38 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc21bQ0HA38 Cst10-202ENSMUST00000109938 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc21bQ0HA38 Gm11540-201ENSMUST00000117457 780 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc21bQ0HA38 Gm15489-201ENSMUST00000132811 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc21bQ0HA38 Gm15472-201ENSMUST00000141652 847 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc21bQ0HA38 Gm11521-201ENSMUST00000143302 329 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc21bQ0HA38 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms