Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Cst10-202ENSMUST00000109938 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Cst10-203ENSMUST00000109939 606 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Mageb16-ps1-201ENSMUST00000117991 1127 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm13454-201ENSMUST00000118166 483 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Vmn1r7-201ENSMUST00000176252 1219 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm29161-201ENSMUST00000188250 699 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm28133-202ENSMUST00000191344 1158 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm42625-201ENSMUST00000198611 922 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm43079-201ENSMUST00000199794 559 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm40418-201ENSMUST00000218806 1013 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 AC144628.1-201ENSMUST00000227943 466 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Cst10-201ENSMUST00000047008 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Cldn10-201ENSMUST00000047761 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Olfr24-201ENSMUST00000066997 1157 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Vmn1r37-206ENSMUST00000228791 1617 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm24239-201ENSMUST00000157791 255 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm21693-201ENSMUST00000178531 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm21677-201ENSMUST00000179508 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm21708-201ENSMUST00000180310 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 2310043L19Rik-201ENSMUST00000189507 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm8521-201ENSMUST00000190394 606 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm6639-204ENSMUST00000199182 800 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm43478-201ENSMUST00000200381 292 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm18452-201ENSMUST00000202968 1111 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm44282-201ENSMUST00000203199 190 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm43903-201ENSMUST00000205126 617 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms