Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Mtcp1-202ENSMUST00000114081 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Mrps33-202ENSMUST00000114797 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm13002-201ENSMUST00000119286 682 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm12668-201ENSMUST00000134966 575 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 2810403D21Rik-204ENSMUST00000144421 747 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Vmn2r-ps13-201ENSMUST00000176920 606 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm19058-201ENSMUST00000192135 598 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 1700018G05Rik-201ENSMUST00000211116 386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 CT025618.1-201ENSMUST00000227409 1279 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Scgb3a1-201ENSMUST00000043873 493 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Cdc42-202ENSMUST00000051477 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm9869-201ENSMUST00000063858 375 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Scgb3a1-202ENSMUST00000076006 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm25483-201ENSMUST00000083224 227 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm15599-201ENSMUST00000122283 1345 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Dpm1-202ENSMUST00000109193 1076 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm13547-202ENSMUST00000113810 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Pex13-ps-201ENSMUST00000118184 1157 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Rps18-ps1-201ENSMUST00000120838 459 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm14145-201ENSMUST00000133385 508 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm14146-201ENSMUST00000155885 508 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm2663-201ENSMUST00000166306 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Muc2-202ENSMUST00000167366 711 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm18182-201ENSMUST00000191380 1251 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm40153-201ENSMUST00000197904 637 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm19798-201ENSMUST00000201502 457 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Fkbp6-203ENSMUST00000201784 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 AC113291.2-201ENSMUST00000215490 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm19090-201ENSMUST00000218187 774 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Mrps14-202ENSMUST00000097193 787 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm38048-201ENSMUST00000193778 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms