Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Gm20852-202ENSMUST00000188011 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Gm18752-202ENSMUST00000193627 587 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Gm6312-201ENSMUST00000204060 1194 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Gm14426-201ENSMUST00000128562 249 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Manf-201ENSMUST00000069036 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Tpbpb-201ENSMUST00000080766 850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms