Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Gm15341-201ENSMUST00000137315 592 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Gm23432-201ENSMUST00000157181 131 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme1P97371 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme1P97371 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme1P97371 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme1P97371 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Hsf2-204ENSMUST00000220042 2430 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Gm7701-201ENSMUST00000163185 1479 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Gstm3-201ENSMUST00000004136 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme1P97371 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Gm12254-201ENSMUST00000134617 471 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Gm14817-201ENSMUST00000148522 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Rarres2-203ENSMUST00000204182 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Gm33570-201ENSMUST00000207608 1254 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme1P97371 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme1P97371 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Klra9-202ENSMUST00000112032 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Gm14633-201ENSMUST00000121152 470 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Gm15373-201ENSMUST00000121495 214 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme1P97371 C430039J16Rik-201ENSMUST00000181148 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Gm21631-201ENSMUST00000195041 754 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Gm8828-201ENSMUST00000196786 1290 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Ckb-ps2-201ENSMUST00000198886 1001 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Tas2r135-201ENSMUST00000070178 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Klra9-201ENSMUST00000071554 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Gm8618-201ENSMUST00000097570 432 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme1P97371 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms