Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Dcx-202ENSMUST00000087313 3120 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Wdr89-202ENSMUST00000187307 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Samd15-202ENSMUST00000182869 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm44531-201ENSMUST00000208364 2000 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Irx2P81066 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Irx2P81066 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Sectm1a-201ENSMUST00000026162 1692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm28988-201ENSMUST00000191363 1897 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Slc17a2-202ENSMUST00000099697 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Acsm2-201ENSMUST00000084647 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Plekho2-201ENSMUST00000068944 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Tle3-217ENSMUST00000162973 4114 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Cfap58-201ENSMUST00000066308 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Irx2P81066 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm31983-202ENSMUST00000210553 3155 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Pibf1-201ENSMUST00000022650 2797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Pogk-206ENSMUST00000169324 7034 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Parpbp-201ENSMUST00000048518 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Rimbp2-207ENSMUST00000200470 4083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Sytl4-202ENSMUST00000113294 2958 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Irx2P81066 4933416O17Rik-201ENSMUST00000220972 2122 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Olfr320-202ENSMUST00000214662 3029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Oacyl-202ENSMUST00000117694 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Smg7-202ENSMUST00000073441 5767 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Cnga3-204ENSMUST00000195272 2197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Cald1-203ENSMUST00000115021 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Irx2P81066 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Gm14616-201ENSMUST00000131690 314 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Irx2P81066 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Irx2P81066 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Irx2P81066 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Irx2P81066 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Irx2P81066 AW146154-201ENSMUST00000098509 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Fam221b-201ENSMUST00000056474 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Washc4-201ENSMUST00000038388 5858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Dcx-204ENSMUST00000112856 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Gm38413-202ENSMUST00000198449 2348 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Irx2P81066 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Adam17-201ENSMUST00000064536 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Kif3a-203ENSMUST00000120613 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Olfr433-201ENSMUST00000052975 2406 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Tsc2-203ENSMUST00000226284 6266 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Slc6a3-201ENSMUST00000022100 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms