Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms