Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm12788-201ENSMUST00000119090 308 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm13281-201ENSMUST00000120871 567 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm7350-201ENSMUST00000120964 636 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 2700069I18Rik-201ENSMUST00000128815 1020 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm17944-201ENSMUST00000186351 643 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm43731-201ENSMUST00000196150 666 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm43761-201ENSMUST00000202132 991 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Olfr752-ps1-201ENSMUST00000208736 1141 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm32872-201ENSMUST00000220037 205 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Ipcef1-202ENSMUST00000086896 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Elk3-204ENSMUST00000151153 1336 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbrP50284 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Ifna13-201ENSMUST00000105149 819 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Nptn-202ENSMUST00000114121 863 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Itpa-ps1-201ENSMUST00000117207 597 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm13147-202ENSMUST00000177526 1173 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm26907-201ENSMUST00000181794 729 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbrP50284 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Tmem212-201ENSMUST00000058077 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Sult3a1-201ENSMUST00000092597 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbrP50284 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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