Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PtpreP49446 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtpreP49446 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PtpreP49446 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtpreP49446 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtpreP49446 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm27427-201ENSMUST00000185134 193 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm37231-201ENSMUST00000191716 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm38159-202ENSMUST00000194145 621 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm37734-201ENSMUST00000194294 621 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm36941-202ENSMUST00000194799 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms