Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 AC165148.1-201ENSMUST00000224795 2372 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm13938-201ENSMUST00000156809 493 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Cdkl5-205ENSMUST00000198931 9796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Dqx1-201ENSMUST00000077502 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gcc2-201ENSMUST00000057659 6547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gk2-201ENSMUST00000059657 1880 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC7.34□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Rreb1-207ENSMUST00000128570 8436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Nfrkb-201ENSMUST00000086167 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
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