Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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