Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Skap2-201ENSMUST00000078214 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Rhox4a-201ENSMUST00000115194 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm13554-201ENSMUST00000137349 477 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Rbm4-201ENSMUST00000164209 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm44700-201ENSMUST00000208228 846 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm18646-201ENSMUST00000212240 1063 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm46329-201ENSMUST00000218373 609 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprmP28828 AC116797.2-203ENSMUST00000225290 565 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm8991-201ENSMUST00000073014 1075 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprmP28828 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Myo1h-209ENSMUST00000199567 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprmP28828 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm5431-201ENSMUST00000109209 1701 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Tmx2-202ENSMUST00000111664 1926 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm16365-201ENSMUST00000122987 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm16334-201ENSMUST00000159488 694 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm5459-201ENSMUST00000171235 798 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Mir5108-201ENSMUST00000175276 85 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Ptma-202ENSMUST00000186255 768 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Atp5g3-201ENSMUST00000018914 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Spata45-202ENSMUST00000192151 443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm33024-201ENSMUST00000203143 633 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm42402-201ENSMUST00000208341 1054 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprmP28828 AC170810.2-201ENSMUST00000228384 1232 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprmP28828 AC161581.1-201ENSMUST00000228696 318 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Cnfn-201ENSMUST00000076276 524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm22982-201ENSMUST00000082613 319 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Ntf3-203ENSMUST00000204542 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm45076-201ENSMUST00000207517 1517 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm10754-202ENSMUST00000220233 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprmP28828 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gpatch1-201ENSMUST00000079693 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm16329-201ENSMUST00000148174 371 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm42441-201ENSMUST00000199778 748 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Tpi-rs11-201ENSMUST00000202145 310 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprmP28828 AC105950.2-201ENSMUST00000220938 368 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprmP28828 CT025579.2-201ENSMUST00000225280 816 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Olfr1219-201ENSMUST00000099797 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm6682-201ENSMUST00000169666 1346 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Slamf9-201ENSMUST00000027830 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gba-201ENSMUST00000077367 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprmP28828 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprmP28828 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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