Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 1700092E19Rik-202ENSMUST00000154703 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Ighv5-12-201ENSMUST00000103450 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Trav13-2-201ENSMUST00000103658 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm3898-201ENSMUST00000180221 613 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm8707-201ENSMUST00000183325 980 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm2087-201ENSMUST00000188217 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm36966-201ENSMUST00000192217 413 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Nudc-ps1-201ENSMUST00000209275 551 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 AC164978.2-201ENSMUST00000226645 857 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Speer4c-201ENSMUST00000095005 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Speer4d-201ENSMUST00000095006 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm37582-201ENSMUST00000192953 1409 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Sgca-201ENSMUST00000100551 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 AU040972-201ENSMUST00000165610 1042 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm26692-201ENSMUST00000180428 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm9578-201ENSMUST00000182354 753 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm29548-201ENSMUST00000187012 694 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm28105-201ENSMUST00000187788 694 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 4930433B08Rik-201ENSMUST00000192010 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm42908-201ENSMUST00000197508 870 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 AC163638.2-201ENSMUST00000224920 827 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms