Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Tmem69-201ENSMUST00000069674 974 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Serpini2-201ENSMUST00000039047 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm28186-201ENSMUST00000187447 679 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm28443-201ENSMUST00000189081 698 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Olfr619-201ENSMUST00000098196 1124 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Kng2-201ENSMUST00000039338 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm44090-201ENSMUST00000204669 1834 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms