Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04213 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04213 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04213 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04213 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04213 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04213 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04213 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04213 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04213 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04213 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04213 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04213 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04213 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04213 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P04213 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04213 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04213 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04213 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04213 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P04213 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P04213 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P04213 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
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