Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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