Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm45210-201ENSMUST00000206401 1577 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Mro-206ENSMUST00000179472 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms