Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms