Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Rplp1-ps1-201ENSMUST00000119410 345 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Spata3-205ENSMUST00000130504 1100 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Gm12668-201ENSMUST00000134966 575 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Gm17147-201ENSMUST00000164176 432 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Gm20483-201ENSMUST00000173162 851 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Gm25694-201ENSMUST00000175448 282 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Fam240a-201ENSMUST00000177678 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Gm42908-201ENSMUST00000197508 870 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Zfp787-203ENSMUST00000207331 376 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Gm3889-201ENSMUST00000212467 612 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Gm18749-201ENSMUST00000222410 692 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 AC123533.3-201ENSMUST00000228056 454 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Gal-201ENSMUST00000025842 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Olfr1384-201ENSMUST00000060434 1034 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 5930420M18Rik-201ENSMUST00000202893 2281 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Cd247-202ENSMUST00000027849 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Use1-203ENSMUST00000110054 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Gm14370-201ENSMUST00000122460 868 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Gm15273-201ENSMUST00000142302 868 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Gm7023-201ENSMUST00000147295 868 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Optc-204ENSMUST00000149380 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Gm14357-201ENSMUST00000178352 868 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Gm14361-201ENSMUST00000178547 868 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Gm14348-201ENSMUST00000179183 868 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Gm3052-201ENSMUST00000186409 829 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Gm37141-201ENSMUST00000191938 422 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Gm38145-201ENSMUST00000192319 693 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 1700048F04Rik-201ENSMUST00000199057 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Gm19566-201ENSMUST00000199576 610 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Gm3137-201ENSMUST00000218177 620 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 AC123061.1-201ENSMUST00000228021 999 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Cxcl3-201ENSMUST00000031326 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Ppih-205ENSMUST00000106321 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Pvalb-202ENSMUST00000120592 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Gm7812-201ENSMUST00000203479 874 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Gimd1-205ENSMUST00000212852 1234 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 AC164614.1-201ENSMUST00000216038 397 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 AC134860.5-201ENSMUST00000225071 1249 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Blvra-202ENSMUST00000110389 657 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Scgb1b21-201ENSMUST00000170232 268 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Mir8104-201ENSMUST00000185165 101 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Gm28809-201ENSMUST00000187542 782 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 B130024G19Rik-204ENSMUST00000191084 634 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms