Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm9877-201ENSMUST00000064271 2627 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms