Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 AC154683.1-201ENSMUST00000228409 1284 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm28701-201ENSMUST00000189778 1010 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Mir706-201ENSMUST00000102262 84 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Speer4c-201ENSMUST00000095005 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Speer4d-201ENSMUST00000095006 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms