Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Lgr5Q9Z1P4 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Lgals9-203ENSMUST00000108269 1586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Lgr5Q9Z1P4 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Lgr5Q9Z1P4 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Lgr5Q9Z1P4 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Lgr5Q9Z1P4 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Lgr5Q9Z1P4 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Lgr5Q9Z1P4 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Lgr5Q9Z1P4 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Lgr5Q9Z1P4 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Lgr5Q9Z1P4 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Lgr5Q9Z1P4 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Lgr5Q9Z1P4 Klf10-203ENSMUST00000227920 2144 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Lgr5Q9Z1P4 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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