Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm8215-201ENSMUST00000120627 990 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 AU040972-201ENSMUST00000165610 1042 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm6098-201ENSMUST00000180234 330 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm37724-201ENSMUST00000195240 1221 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm42438-201ENSMUST00000197832 974 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm7688-201ENSMUST00000212857 337 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Olfr44-203ENSMUST00000216316 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Reg2-201ENSMUST00000023906 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Olfr622-201ENSMUST00000058744 1105 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Olfr44-201ENSMUST00000077757 1071 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Cntnap2-201ENSMUST00000060839 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Amelx-204ENSMUST00000112120 727 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm25317-201ENSMUST00000116824 129 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 2810403D21Rik-204ENSMUST00000144421 747 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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SrfQ9JM73 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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