Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Adh1-201ENSMUST00000004232 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm14538-201ENSMUST00000122019 1327 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Igkv3-9-201ENSMUST00000103398 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm3404-201ENSMUST00000110596 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Rhox10-201ENSMUST00000115150 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Rhox3f-201ENSMUST00000115172 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Fgf1-203ENSMUST00000117566 418 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm26978-201ENSMUST00000182843 304 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Rhox3f-203ENSMUST00000184451 1008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm8625-201ENSMUST00000194185 1077 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm5845-201ENSMUST00000195812 796 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Fkbp6-203ENSMUST00000201784 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm44700-201ENSMUST00000208228 846 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 AC154433.1-201ENSMUST00000224401 1183 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 AC116797.2-203ENSMUST00000225290 565 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Txk-203ENSMUST00000197313 2190 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Btn2a2-204ENSMUST00000223877 2109 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Ighv5-15-201ENSMUST00000103457 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Eif4a-ps4-201ENSMUST00000122226 1218 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm25804-201ENSMUST00000122785 188 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm8464-202ENSMUST00000146697 1142 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm4750-201ENSMUST00000151942 1142 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm7251-201ENSMUST00000182661 1009 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm37232-201ENSMUST00000194887 367 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm6370-202ENSMUST00000198912 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm29803-201ENSMUST00000205069 375 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Smim4-201ENSMUST00000049732 311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm4925-202ENSMUST00000168843 1561 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 C8b-202ENSMUST00000065072 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm28453-201ENSMUST00000185556 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Ighv1-56-201ENSMUST00000103527 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Col5a3Q9JLI2 Ighv1-8-201ENSMUST00000192236 293 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Tdrkh-203ENSMUST00000196386 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm18749-201ENSMUST00000222410 692 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Rpl21-ps2-201ENSMUST00000222933 481 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Cd14-201ENSMUST00000061829 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Tstd2-202ENSMUST00000107772 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Ifitm7-202ENSMUST00000178021 1823 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm15383-201ENSMUST00000121889 1443 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm44664-201ENSMUST00000206841 1786 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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