Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm4651-201ENSMUST00000181738 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 1700006F04Rik-201ENSMUST00000188582 441 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm28639-201ENSMUST00000191519 481 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm44920-201ENSMUST00000206503 746 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Olfr966-ps1-201ENSMUST00000214875 577 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 AC174082.2-201ENSMUST00000222094 543 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm4894-201ENSMUST00000067007 357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Dcpp1-201ENSMUST00000068580 617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Tmsb15a-201ENSMUST00000073674 299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 n-R5s196-201ENSMUST00000083136 117 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Olfr831-ps1-201ENSMUST00000086496 890 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 2310034C09Rik-201ENSMUST00000089111 946 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Olfr894-201ENSMUST00000093866 949 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm43154-208ENSMUST00000209658 1442 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 AC154522.1-201ENSMUST00000224647 1903 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Fancd2os-201ENSMUST00000035870 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 CT025618.1-202ENSMUST00000226439 1758 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm12361-201ENSMUST00000119806 1044 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm14979-201ENSMUST00000121561 1035 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm15563-201ENSMUST00000124953 410 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 D130017N08Rik-201ENSMUST00000180460 510 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Stpg4-203ENSMUST00000187078 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm28430-201ENSMUST00000191031 628 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Prkar2a-206ENSMUST00000195405 1143 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm43396-201ENSMUST00000197506 706 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm34783-201ENSMUST00000209159 303 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm3011-201ENSMUST00000215669 582 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm8290-201ENSMUST00000218202 477 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm8137-201ENSMUST00000218997 463 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 AC156803.1-201ENSMUST00000224407 820 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 AC133598.3-207ENSMUST00000225918 704 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 CT025525.3-201ENSMUST00000228858 366 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm22043-201ENSMUST00000082993 158 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Tmem260-202ENSMUST00000124720 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm44914-201ENSMUST00000207191 2720 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm44581-201ENSMUST00000206227 1693 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms