Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm28138-201ENSMUST00000186250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm29270-201ENSMUST00000188071 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm29392-201ENSMUST00000189429 2167 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm29252-201ENSMUST00000189869 2167 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm29305-201ENSMUST00000191054 2167 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Hmgb1-201ENSMUST00000085546 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Ccdc97Q9DBT3 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Ccdc97Q9DBT3 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
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Ccdc97Q9DBT3 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Ccdc97Q9DBT3 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Ccdc97Q9DBT3 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Ccdc97Q9DBT3 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Ccdc97Q9DBT3 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Ccdc97Q9DBT3 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Ccdc97Q9DBT3 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ccdc97Q9DBT3 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ccdc97Q9DBT3 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ccdc97Q9DBT3 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ccdc97Q9DBT3 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ccdc97Q9DBT3 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ccdc97Q9DBT3 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm44597-202ENSMUST00000203287 3516 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Ilf3-213ENSMUST00000216892 3684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Fes-201ENSMUST00000080932 2762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm38001-201ENSMUST00000192900 3761 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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