Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
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Zbed3Q9D0L1 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Zbed3Q9D0L1 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Zbed3Q9D0L1 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Rasgrp1-204ENSMUST00000173252 1750 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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