Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Snx10Q9CWT3 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Snx10Q9CWT3 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Snx10Q9CWT3 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Snx10Q9CWT3 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Snx10Q9CWT3 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Snx10Q9CWT3 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx10Q9CWT3 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms