Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm21943-201ENSMUST00000178181 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm20917-202ENSMUST00000188706 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm33093-201ENSMUST00000197751 790 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 4930558F17Rik-201ENSMUST00000197789 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm43640-201ENSMUST00000199000 786 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm33847-201ENSMUST00000199294 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm43492-201ENSMUST00000199522 786 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm38560-201ENSMUST00000220169 646 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Olfr898-201ENSMUST00000076504 951 ntAPPRIS P2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm10558-201ENSMUST00000147494 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm44562-201ENSMUST00000207194 1347 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Amelx-204ENSMUST00000112120 727 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Cldn16-201ENSMUST00000115302 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm20689-201ENSMUST00000176033 279 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Lrp1b-212ENSMUST00000204204 798 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 AC159293.2-201ENSMUST00000222289 424 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Stap1-201ENSMUST00000031171 909 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm43771-201ENSMUST00000202931 1578 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms