Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ49

Ncbp2, Nuclear cap-binding protein subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncbp2Q9CQ49 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ncbp2Q9CQ49 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms