Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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