Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Brcc3-201ENSMUST00000033544 4310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 D030055H07Rik-201ENSMUST00000143956 2712 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Tmprss13-201ENSMUST00000034597 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Slc7a14-202ENSMUST00000108245 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Irf9-203ENSMUST00000134863 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Pik3c3-201ENSMUST00000091978 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Erich3-202ENSMUST00000098496 8280 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Pla2g4e-201ENSMUST00000090071 4477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Cdh18-207ENSMUST00000226693 2165 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Fubp1-201ENSMUST00000106121 4525 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Fxr1-208ENSMUST00000200392 3014 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Ggct-202ENSMUST00000131475 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Gm30373-201ENSMUST00000215774 3500 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm10390-202ENSMUST00000181905 4269 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm45768-201ENSMUST00000206763 3202 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Ik-201ENSMUST00000007042 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Ptchd4-201ENSMUST00000048691 6890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Prdx6-202ENSMUST00000071718 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Trak1-211ENSMUST00000211187 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Utp15-201ENSMUST00000040972 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Rpgrip1-213ENSMUST00000181401 3963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 5930420M18Rik-201ENSMUST00000202893 2281 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Bsn-201ENSMUST00000035208 15938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm4454-201ENSMUST00000190585 2578 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Npnt-205ENSMUST00000117456 3383 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm26815-201ENSMUST00000181200 3366 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Atg7-201ENSMUST00000032457 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Txndc16-205ENSMUST00000139526 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Mid1-204ENSMUST00000112104 3860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Wdr24-201ENSMUST00000026833 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Radil-202ENSMUST00000085758 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Reep1-203ENSMUST00000212792 3339 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms