Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Rpap2-201ENSMUST00000065422 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Dcc-201ENSMUST00000073379 4855 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Uroc1-201ENSMUST00000046128 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Slc28a1-202ENSMUST00000119083 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Ptk2b-202ENSMUST00000089250 3903 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Nkx2-2os-201ENSMUST00000136998 4345 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 9130019O22Rik-201ENSMUST00000049052 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 E2f7-204ENSMUST00000173471 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Pdzd7-202ENSMUST00000145391 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Rasal1-205ENSMUST00000156722 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms