Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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