Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Ccl6-201ENSMUST00000019071 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Gm24981-201ENSMUST00000104459 132 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Igsf5-204ENSMUST00000113795 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Rhox3f-201ENSMUST00000115172 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Rfc4-203ENSMUST00000115338 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Eif4a-ps4-201ENSMUST00000122226 1218 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Gm13778-202ENSMUST00000146633 537 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Gm15587-202ENSMUST00000156403 709 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Gm23521-201ENSMUST00000177845 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Gm19668-201ENSMUST00000178581 747 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Rhox3f-203ENSMUST00000184451 1008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 1700030N03Rik-206ENSMUST00000191405 651 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Gm5851-201ENSMUST00000194132 1204 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Gm43821-201ENSMUST00000199198 729 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Olfr139-203ENSMUST00000206280 1059 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Gm2696-201ENSMUST00000220062 723 ntAPPRIS P5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 AC129017.2-201ENSMUST00000226118 1284 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Fibp-201ENSMUST00000025847 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 BC048562-201ENSMUST00000057265 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 H2-DMb2-202ENSMUST00000171231 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Gm45076-201ENSMUST00000207517 1517 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Gm15661-201ENSMUST00000117390 556 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Gm13792-201ENSMUST00000121350 423 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Gm13781-201ENSMUST00000124153 492 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Pttg1ip-208ENSMUST00000162943 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Lrit1Q8K099 Gm42875-201ENSMUST00000197674 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Gm43965-201ENSMUST00000203779 789 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Pcbd1-202ENSMUST00000218005 361 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Gm18504-201ENSMUST00000220917 929 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Lrit1Q8K099 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Slc35b3-201ENSMUST00000021870 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Lrit1Q8K099 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Lrit1Q8K099 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Gm5046-201ENSMUST00000100608 611 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Tmem254c-201ENSMUST00000100818 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Lrit1Q8K099 Gm12976-201ENSMUST00000150171 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Scgb1b27-202ENSMUST00000173387 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Gm5627-201ENSMUST00000178539 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Rbp2-204ENSMUST00000189446 803 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Lrit1Q8K099 Gm2566-201ENSMUST00000201267 431 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Fxyd7-202ENSMUST00000206341 620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Gm32098-201ENSMUST00000211305 479 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 AC165249.1-203ENSMUST00000219976 392 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Gm34983-202ENSMUST00000220432 494 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Fxyd7-201ENSMUST00000073892 693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Ccdc83-201ENSMUST00000040413 1546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Lrit1Q8K099 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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