Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Lrrc9Q8CDN9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Lrrc9Q8CDN9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc9Q8CDN9 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Lrrc9Q8CDN9 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Lrrc9Q8CDN9 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc9Q8CDN9 Ccser2-203ENSMUST00000182042 1420 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc9Q8CDN9 CN725425-201ENSMUST00000109284 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Lrrc9Q8CDN9 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc9Q8CDN9 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Lrrc9Q8CDN9 2310016D03Rik-201ENSMUST00000190206 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc9Q8CDN9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Lrrc9Q8CDN9 Rhox4a-201ENSMUST00000115194 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Lrrc9Q8CDN9 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Lrrc9Q8CDN9 Crygc-201ENSMUST00000027089 783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Lrrc9Q8CDN9 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Lrrc9Q8CDN9 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc9Q8CDN9 Gm26241-201ENSMUST00000174944 101 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms