Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Klk1b26-201ENSMUST00000048945 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Zfp324-201ENSMUST00000038701 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Igsf11-202ENSMUST00000114706 1578 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Gm16283-201ENSMUST00000149935 522 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 CAAA01125382.3-201ENSMUST00000215277 643 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Gm23458-201ENSMUST00000083257 169 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Parva-201ENSMUST00000033030 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 AC158777.1-201ENSMUST00000226216 1724 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 AA623943-201ENSMUST00000121794 354 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Gm14699-201ENSMUST00000122340 228 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Gm12273-201ENSMUST00000137418 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Snhg3-202ENSMUST00000141090 581 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Gm12972-201ENSMUST00000152986 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Gm12847-201ENSMUST00000156219 413 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Gm16227-201ENSMUST00000160088 563 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Gm17514-201ENSMUST00000181863 1102 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Gm8707-201ENSMUST00000183325 980 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Gm29595-202ENSMUST00000187954 466 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Ighv5-12-4-201ENSMUST00000195381 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Nudc-ps1-201ENSMUST00000209275 551 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 AC127583.1-201ENSMUST00000224351 540 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms