Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm7984-201ENSMUST00000060640 538 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Olfr847-201ENSMUST00000079620 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Olfr1051-201ENSMUST00000099898 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm19583-201ENSMUST00000202993 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm44850-201ENSMUST00000205621 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Znhit3-201ENSMUST00000103195 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm14197-201ENSMUST00000117480 1049 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm12639-201ENSMUST00000121400 493 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Ugt2a2-202ENSMUST00000144144 929 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Vmn2r-ps35-201ENSMUST00000169206 831 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Obox2-203ENSMUST00000174076 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm5252-201ENSMUST00000189030 909 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Csn1s2a-203ENSMUST00000196749 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 1700048F04Rik-201ENSMUST00000199057 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Clec2g-206ENSMUST00000204259 893 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Trim35Q8C006 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Trim35Q8C006 Serf1-201ENSMUST00000022145 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Vmn1r193-201ENSMUST00000057516 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm6369-201ENSMUST00000069626 412 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Ube2u-202ENSMUST00000133493 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Spp1-202ENSMUST00000086833 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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