Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Kyat1-203ENSMUST00000113660 1388 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Rab26-204ENSMUST00000176533 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Gm45090-201ENSMUST00000208775 1148 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Speer4f1-201ENSMUST00000076099 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx17Q8BVL3 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Snx17Q8BVL3 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Snx17Q8BVL3 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Snx17Q8BVL3 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Snx17Q8BVL3 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Snx17Q8BVL3 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Snx17Q8BVL3 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Snx17Q8BVL3 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Snx17Q8BVL3 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Snx17Q8BVL3 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Snx17Q8BVL3 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Snx17Q8BVL3 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Snx17Q8BVL3 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Snx17Q8BVL3 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Snx17Q8BVL3 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Snx17Q8BVL3 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx17Q8BVL3 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx17Q8BVL3 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx17Q8BVL3 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx17Q8BVL3 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx17Q8BVL3 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx17Q8BVL3 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx17Q8BVL3 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx17Q8BVL3 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx17Q8BVL3 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx17Q8BVL3 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx17Q8BVL3 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx17Q8BVL3 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx17Q8BVL3 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx17Q8BVL3 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx17Q8BVL3 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx17Q8BVL3 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx17Q8BVL3 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx17Q8BVL3 Gm13777-201ENSMUST00000118208 345 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx17Q8BVL3 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx17Q8BVL3 Gm18552-201ENSMUST00000187425 538 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx17Q8BVL3 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx17Q8BVL3 Gm44917-201ENSMUST00000208798 520 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx17Q8BVL3 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx17Q8BVL3 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx17Q8BVL3 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx17Q8BVL3 AC124356.1-201ENSMUST00000221469 698 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx17Q8BVL3 Krtap3-2-201ENSMUST00000092699 1031 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx17Q8BVL3 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx17Q8BVL3 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx17Q8BVL3 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx17Q8BVL3 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx17Q8BVL3 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx17Q8BVL3 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx17Q8BVL3 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.4 ms