Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Gm13002-201ENSMUST00000119286 682 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Trav9n-1-201ENSMUST00000185224 339 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Gm37486-201ENSMUST00000195663 405 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Rpl21-ps2-201ENSMUST00000222933 481 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Gm44907-201ENSMUST00000207423 1633 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Btn2a2-204ENSMUST00000223877 2109 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Lrrc23-202ENSMUST00000112475 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 H2-M10.4-201ENSMUST00000057502 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Gm45895-201ENSMUST00000212248 1697 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Rhox3f-201ENSMUST00000115172 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Rhox4a-201ENSMUST00000115194 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Pdc-201ENSMUST00000165062 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Gm20467-201ENSMUST00000172872 994 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Rhox3f-203ENSMUST00000184451 1008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Cryab-205ENSMUST00000216755 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 4930547H16Rik-201ENSMUST00000222281 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 AC157650.1-201ENSMUST00000224582 610 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Msln-201ENSMUST00000075884 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Krtap21-1-201ENSMUST00000078422 748 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Gba-201ENSMUST00000077367 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Gm13303-201ENSMUST00000117125 1284 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Gm11365-201ENSMUST00000144277 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Gm17250-201ENSMUST00000180494 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Ighv1-8-201ENSMUST00000192236 293 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Gm35299-201ENSMUST00000195865 421 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Oprk1-201ENSMUST00000027038 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Gm38246-201ENSMUST00000194318 1511 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Supt20-ps-201ENSMUST00000117999 1560 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Gm9095-201ENSMUST00000117607 881 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Gm9097-201ENSMUST00000120514 880 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Gm14108-201ENSMUST00000122234 494 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Gm12221-201ENSMUST00000125096 1131 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Gm17815-201ENSMUST00000198305 895 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Pfkfb3-215ENSMUST00000183869 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Rdh7-201ENSMUST00000047199 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Gm11231-201ENSMUST00000117895 1706 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Gm6141-201ENSMUST00000117181 695 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Lypla1-203ENSMUST00000119612 529 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Pou1f1-205ENSMUST00000184525 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Gm28653-202ENSMUST00000227082 521 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Gm6378-201ENSMUST00000084199 444 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Ccl6-201ENSMUST00000019071 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Krtap29-1-201ENSMUST00000105051 1029 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Gm13197-201ENSMUST00000117204 225 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Mettl7b-201ENSMUST00000026398 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Casp14-201ENSMUST00000005488 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
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