Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms