Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprdQ64487 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
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PtprdQ64487 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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PtprdQ64487 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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PtprdQ64487 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
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PtprdQ64487 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
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PtprdQ64487 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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PtprdQ64487 Prl8a1-202ENSMUST00000095926 1682 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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PtprdQ64487 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Atp5e-201ENSMUST00000016396 421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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PtprdQ64487 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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PtprdQ64487 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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PtprdQ64487 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Gm8216-201ENSMUST00000117232 601 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
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PtprdQ64487 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
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