Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Dnaja1-201ENSMUST00000030118 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm8914-201ENSMUST00000101396 1035 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm5071-201ENSMUST00000104922 1035 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 S100a16-205ENSMUST00000107334 879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Snx10-202ENSMUST00000114439 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Chn2-209ENSMUST00000146114 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm16013-201ENSMUST00000152249 353 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm24368-201ENSMUST00000175388 106 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm7672-201ENSMUST00000180915 872 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Tex35-206ENSMUST00000187546 856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm18621-201ENSMUST00000222677 679 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 3110083C13Rik-202ENSMUST00000224786 907 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Eif3m-201ENSMUST00000028592 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Cxcl3-201ENSMUST00000031326 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm5072-201ENSMUST00000063726 1035 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Ucp1-201ENSMUST00000034146 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Cd247-202ENSMUST00000027849 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 1700112J05Rik-201ENSMUST00000129353 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm1758-201ENSMUST00000164528 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm9117-201ENSMUST00000177735 1098 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm38004-201ENSMUST00000192972 357 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Rps27-202ENSMUST00000195998 458 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm30652-201ENSMUST00000199103 430 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Cryab-205ENSMUST00000216755 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Oprk1-201ENSMUST00000027038 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 5930420M18Rik-201ENSMUST00000202893 2281 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Ccna1-204ENSMUST00000198320 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Lyrm1-204ENSMUST00000106518 875 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm11771-201ENSMUST00000118124 732 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm17147-201ENSMUST00000164176 432 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Glmp-207ENSMUST00000176425 960 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gimd1-205ENSMUST00000212852 1234 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 AC151971.6-201ENSMUST00000216193 866 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 AC156274.1-201ENSMUST00000219193 634 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm6727-201ENSMUST00000204102 1518 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Dcstamp-201ENSMUST00000022913 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Uros-204ENSMUST00000106146 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm7190-201ENSMUST00000118669 1452 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Olfr543-202ENSMUST00000219647 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Vps45-201ENSMUST00000015891 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm44664-201ENSMUST00000206841 1786 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
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